Eeppisen syvällinen ja vilpitön Shenandoah kertoo dramaattisen tarinan miehestä, joka joutuu vaikean valinnan eteen. James Stewart (Erään murhan anatomia) esittää virginialaista farmaria Charlie Andersonia sisällissodan aikana. Hän kieltäytyy tukemasta Etelävaltioita, koska vastustaa orjuutta, muttei halua tukea myöskään Pohjoisvaltioita, koska vastustaa sotaa. Lähtiessään etsimään vangiksi joutunutta poikaansa Charlie kohtaa sodan kauhut ja joutuu vihdoin valitsemaan puolensa.