Lähde mukaan ja liity Espanjan, Englannin, Ranskan ja Alankomaiden siirtomaavoimiin taistelussa Karibianmeren ylivallan puolesta 1600-luvulla. Port Royale 4:ssä sinusta tulee siirtokunnan nuori ja kunnianhimoinen kuvernööri, joka on innokas oppimaan hallitsemaan tätä pientä asutusta ja tekemään siitä täpötäynnä kauppakaupunki. Hän kehittää rakennusketjuja, jotka yhdistyvät eri saarille, ja luo kokonaisia kauppareittejä koko Karibianmerelle palvelemaan kaupunkien (jatkuvasti kasvavia) tarpeita. Käytä yksityiskohtaista merikarttaa välttääksesi myrskyn aiheuttamia alueita, kallioita ja matalia vesiä. Suorita maasi varakuninkaan tehtäviä ja ansaitset lisää mainetta, joka avaa kaupunkirakennuksia, laivoja ja paljon muuta. Valloita kilpailevien maiden kaupunkeja tai hyökkää vihollisen laivoja vastaan merkkikirjaimella pitäen samalla silmällä merirosvoja ja muita korsaareja. Ensimmäistä kertaa sarjassa meritaistelut ovat vuoropohjaisia ja niihin voi osallistua samanaikaisesti jopa 10 alusta, ja kapteenien taktisilla liikkeillä selvitään vaikeimmistakin tilanteista selviytyäkseen voitoksi.