The Gapt kertoo vaikean tarinan miehen kamppailusta löytää parannuskeino perheensä sairauteen tutkimalla rinnakkaisia todellisuuksia, jotka sisältävät hänen sydämelleen rakkaita muistoja ja pakottavat hänet sukeltamaan syvemmälle psyykeensä.

Joshua Hayes on neurotieteilijä, jonka perheeseen vaikuttaa harvinainen neurologinen sairaus, joka syö hitaasti ihmisen henkistä kapasiteettia ja hyvinvointia. Perheen kamppailuja todistetaan heidän elämänsä korkeimpien ja matalimpien hetkien kautta. Kun Joshua tutkii raakoja, minimalistisia tiloja, hän kohtaa elementtejä, jotka toimivat portteina hänen menneisyyteensä.

Lisäksi osallistuessaan Neuraxis-biotekniikkajätin vetämään kokeelliseen neurotieteelliseen ohjelmaan Joshua joutuu tahtomattaan sekaantumaan yrityksen juonitteluun.

Toivoen voivansa purkaa muistojen verkkoa, hän joutuu kohtaamaan ahdistavan kysymyksen: voiko hän todella luottaa itseensä?