Yonder sijoittuu Gemean massiiviselle saarelle, joka on rehevä rajaseutu, jossa on kahdeksan erilaista ympäristöä aurinkoisista trooppisista rannoista jäätäviin lumihuippuihin. Jokaisessa paikassa on oma kasvistonsa ja eläimistönsä sekä vaihtuvat vuodenajat ja päivä-yö-sykli. Gemea, joka oli kerran paratiisi, näyttää yhä siltä, mutta paha hämärä on peittänyt maan ja sen asukkaat epätoivoon.

Antamalla panoksensa saarelle esimerkiksi maanviljelyn, käsityön, ruoanlaiton, kalastuksen ja panimotoiminnan avulla voit luoda suhteita paikallisiin, jotka tarjoavat palkinnoksi kaikkea resursseista uuteen maatilaan.