Toisesta maailmasta saapuneet valloittajat hyökkäävät varoittamatta – päästäen kone-elämänmuodot irti. Ihmiskunta ajetaan ylivoimaisen uhan edessä Maasta ja hakemaan turvaa Kuusta.
Ihmiset kehittävät androidisotilaiden armeijan taistelemaan mekaanista laumaa vastaan onnistuen vain hidastamaan sen etenemistä. Umpikuja yritetään murtaa lähettämällä taisteluun uudenlainen androidijalkaväki: YoRHa-joukkue.
Koneiden ja androidien välinen sota riehuu Maan unohdetuilla joutomailla. Ja tämä sota paljastaa pian kauan sitten unohdetun totuuden tästä maailmasta...