Middle-earth: Shadow of Mordor tarjoaa dynaamisen peliympäristön, jossa pelaajan on suunniteltava oma kostosuunnitelmansa. Peli alkaa sinä iltana, jolloin Sauron palaa Mordoriin, kun hänen mustat kapteeninsa teloittavat raa´asti Mustan portin partiolaiset. Pelaajat ottavat vastaan Talionin, rohkean tutkimusmatkailijan roolin, jonka perhe tapetaan samana yönä ja joka herätetään henkiin koston hengen kautta tuhotakseen ne, jotka ottivat kaiken, mitä hän piti rakkaana. Talionin henkilökohtaisen koston aikana pelaaja löytää totuuden häntä ohjaavasta Hengestä, oppii voimarenkaiden alkuperästä ja kohtaa lopulta viimeisen vihollisensa. Middle-earth: Shadow of Mordor tarjoaa uuden tarinan, joka sijoittuu Hobitin ja Taru sormusten herrasta tapahtumien väliin, ja tarjoaa elävän seuraavan sukupolven maailman, jossa on mukana täysin uusi Nemesis-järjestelmä. Tämän järjestelmän ansiosta suhteet vihollisiin ja heidän ominaisuudet muovautuvat pelaajan toimien ja päätösten perusteella luodakseen arkkivihollisia, jotka muistavat ja mukautuvat pelityyliimme ja käyttäytyvät eri tavalla jokaisessa istunnossa.