Peli vie pelaajat aikakauteen, jolloin Cocoon murenee. Tässä uudessa maailmassa kaikki olettavat, että Salama on kuollut, paitsi Sara, joka ei ole koskaan luopunut siskostaan. Uusi hahmo astuu kuvaan mukaan. Noelilla on voimakkaita loitsuja hihassaan, ja yhdessä Saran ja Mooglen kanssa he lähtevät tutkimaan tuntemattomia maita. Hirviöt hyökkäävät laumoittain ja taistelun jälkeen pelaajille tarjotaan mahdollisuus ystävystyä näiden petojen kanssa. Kaikilla pedoilla on erikoistaitoja, joten hyödynnä niitä tehostaaksesi hyökkäyksiäsi. Elokuvallisilla leikkauksilla on suuri merkitys taisteluissa. Paina oikeaa painiketta ruudulla olevissa sekvensseissä käynnistääksesi varman tappotaidon.