Päähenkilö, Tokugawa Takechiyo, lähtee taisteluun ajan ja avaruuden tuolla puolen muuttaakseen kohtaloaan ja pelastaakseen Japanin yokaiden otteesta. Koe intensiivistä tutkimusmatkaa laajassa avoimessa maailmassa ja vaihda saumattomasti samurain ja ninjan välillä silmänräpäyksessä. Kohtaa laaja valikoima historiallisia henkilöitä. Koe jännittävä ja haastava taistelu, jonka vain Nioh voi tarjota.